Nhà Sinh Học Trẻ

Diễn Đàn của những Bạn Trẻ yêu thích Sinh Học
Hôm nay, Thứ bảy 15/08/20 2:16 am

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Nội quy chuyên mục


Không gởi bài xin tài liệu trong chuyên mục này (xem chuyên mục "Tài liệu theo yêu cầu")



Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 20 bài viết ]  Chuyển đến trang Trang trước  1, 2
Người gửi Nội dung
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 11/07/06 11:13 am 
Ngoại tuyến
Chuyên gia
Chuyên gia

Ngày tham gia: Thứ hai 10/07/06 11:09 pm
Bài viết: 363
Trích dẫn:
...Nhưng với bioinformatics, toán và tin học đóng vai trò 40-50%, phần còn lại là kiến thức về sinh học, hóa học, vật lý... Không có sự hiểu biết về các quy luật sinh học, nguyên lý hóa học, vật lý, ứng dụng của bioinformatics chỉ dừng lại ở những bài toán sinh học đơn giản (tìm sự tương đồng trình tự, dự đoán vị trí gene...). Những bài toán phức tạp (dự đoán chức năng của một protein mới, phân lớp protein... như bạn nói) cần phải có kiến thức sinh, hóa, lý. Vì sao? Vì cơ thể sống vận động tuân theo các định luật vật lý và hóa học trong khi toán học không thể mô tả hết mọi thứ bằng công thức và hàm số (nhiều hiện tượng tự nhiên còn ngoài tầm tri thức của nhân loại).


Không phủ nhận việc làm về bioinformatics phải có kiến thức về biology - tất nhiên rồi :) - Tuy nhiên, hiện tôi đang giải bài toán tiên đoán chức năng của protein dựa trên các tương tác protein (PPI) nhưng chỉ dùng các kiến thức về tin học cùng với các dữ liệu protein đã được số hóa tại DIP, Swissprot và BIND - cụ thể là dùng các kỹ thuậy learning machine/data mining - chứ không liên quan đến đến các kỹ thuật thực nghiệm ;) Hiển nhiên, mỗi phương pháp đều có các ưu nhược điểm riêng của nó :)

Hiện nay có rất nhiều nghiên cứu/bài báo ở dạng này, cụ thể là hằng năm đều có các hội thảo về data mining (PAKDD là một trong các hội thảo đó được tổ chức hàng năm tại châu Á, năm ngoái 2005 là tổ chức tại Hà Nội và năm nay là tại Singapore ;)) có rất nhiều các nghiên cứu về các giải thuật/công cụ tin học để giải quyết các bài toán biology.

Nói như vậy để thấy rằng cũng không nhất thiết phải giải quyết các bài toán bioinformatics thông qua con đường thực nghiệm :)

Trích dẫn:
Túm lại, xem bioinformatics là 1 môn học của computer science cũng được. Nhưng đánh đồng nó như các môn học đặc thù của CNTT thì e là bạn chưa hiểu hết ý nghĩa của từ bioinformatics. :)


Tôi không có ý định xem bioinformatics là một môn học mà là một chuyên ngành hẹp của ngành CS.
Đồ họa máy tính cũng thế, nó không đơn thuần là một môn học mà là một chuyên ngành hẹp về xử lý đồ họa trên máy tính ;) bao gồm rất nhiều môn học.

Thân ái

P.S: Đúng rồi, làm luận án mà được HD từ xa thế này muôn vàn khó khăn atuan ơi, Đặc biệt đây là lĩnh vực còn hiếm người quan tâm ở VN. Anh có kinh nghiệm gì chia xẻ cho mình với. Cám ơn anh nhiều.


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 11/07/06 6:35 pm 
Ngoại tuyến
god - active member
god - active member
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ hai 21/02/05 12:20 am
Bài viết: 977
Đến từ: Uni. Stuttgart, Germany
Trích dẫn:
tôi đang giải bài toán tiên đoán chức năng của protein dựa trên các tương tác protein
Đùa một chút nhé: Theo pppnnn thì tương tác protein có ý nghĩa gì trong sinh học? :)

Trích dẫn:
Nói như vậy để thấy rằng cũng không nhất thiết phải giải quyết các bài toán bioinformatics thông qua con đường thực nghiệm
Không phải dùng thực nghiệm để "giải" mà dùng thực nghiệm để kiểm chứng pppnnn à. Cũng không phải lúc nào data mining giải hết được các ẩn số của tự nhiên cũng như thỏa mãn nhu cầu của người làm sinh học. Theo kinh nghiệm của mình, nếu bạn biết các quy luật vận động của tự nhiên, việc áp dụng IT sẽ dễ dàng hơn. Vd: 4 năm trước khi bắt tay vào làm mô phỏng động lực học phân tử (molecular dynamics simulation), atuan nghĩ với cac super computer là người ta có thể mô phỏng mọi thứ. Giờ thì hiểu rằng kết quả mình làm được trên máy tính chỉ là 1 phần rất nhỏ trong vô vàn khả có thể xảy ra năng trong tự nhiên. :)

Trích dẫn:
P.S: Đúng rồi, làm luận án mà được HD từ xa thế này muôn vàn khó khăn atuan ơi, Đặc biệt đây là lĩnh vực còn hiếm người quan tâm ở VN. Anh có kinh nghiệm gì chia xẻ cho mình với. Cám ơn anh nhiều.
Kinh nghiệm á. "Gone with the wind" rồi. Hi hi... :) Chẳng có kinh nghiệm gì, chỉ là "phải tự thân vận động" thôi.

...

Rất hoan nghênh dự án nghiên cứu của bạn 3p3n. Nếu có điều kiện, bạn 3p3n giới thiệu nên thêm về đề tài của bạn, chắc chắn sẽ có những trao đổi và phản hồi tích cực. Trong forum này có 2 thành viên becon và sakura cũng khá rành về bioinformatics. :)

_________________
atuan


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ sáu 14/07/06 5:46 pm 
Ngoại tuyến
Người điều hành
Người điều hành
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ hai 21/02/05 12:54 pm
Bài viết: 216
Đến từ: Không cần biết em là ai. Không cần biết em từ đâu ...
atuan đã viết:

Rất hoan nghênh dự án nghiên cứu của bạn 3p3n. Nếu có điều kiện, bạn 3p3n giới thiệu nên thêm về đề tài của bạn, chắc chắn sẽ có những trao đổi và phản hồi tích cực. Trong forum này có 2 thành viên becon và sakura cũng khá rành về bioinformatics. :)


hìhì, khá quan tâm thì đúng hơn. Chẳng thấy rành gì cả, càng ngày càng tối mù mù :) :)

_________________
******************************
Don't ask me why ...


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ bảy 15/07/06 10:14 pm 
Ngoại tuyến
Chuyên gia
Chuyên gia

Ngày tham gia: Thứ hai 10/07/06 11:09 pm
Bài viết: 363
becon đã viết:
hìhì, khá quan tâm thì đúng hơn. Chẳng thấy rành gì cả, càng ngày càng tối mù mù :) :)


Nếu thực sự bạn quan tâm thì xem ở đây và góp ý giùm tôi nhé:

http://www.nhasinhhoctre.com/forum/view ... c&&start=0

Thanksssssssssssssss


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re:
Gửi bàiĐã gửi: Chủ nhật 20/03/11 2:04 am 
Ngoại tuyến
chaos

Ngày tham gia: Chủ nhật 20/03/11 1:11 am
Bài viết: 3
Đến từ: HCM
atuan đã viết:
Rất hoan nghênh dự án nghiên cứu của bạn 3p3n. Nếu có điều kiện, bạn 3p3n giới thiệu nên thêm về đề tài của bạn, chắc chắn sẽ có những trao đổi và phản hồi tích cực. Trong forum này có 2 thành viên becon và sakura cũng khá rành về bioinformatics. :)


Ái chà, có các anh chị chuyên về bioinformatics, thật sự sướng. Em đang làm NCS về lĩnh vực này mà cũng đang rối mù lên. Gốc là CS, nhưng cũng hơi hơi yêu thích về mảng này lúc thực tập thạc sĩ nên sẵn làm luôn. Hiện tại, mảng em đang làm là nghiên cứu về metabolism. Có anh chị nào tìm hiểu về cái này chưa, chỉ giáo em với.

Theo như em được hỏi (nhiều người hỏi em :)), làm về Bioinformatics thì có biết gì RNA, DNA, Genes etc. hay không? Quả thật là em "say no". Vì hiện tại công việc của em là tìm hiểu về cách mô hình (model visualize) mạng các phản ứng sinh hóa (chủ yếu các các phản ứng trong cơ thể sống của cây). Qua đó, tích hợp các đặc điểm sinh học của nó, tạo ra các tương tác nhờ những thuật toán về đồ thị trên máy tính. Từ đó, phân tích và tìm ra một số pathway nhất định.

Em nghĩ đó cũng là một hướng hiện nay nhiều người làm. Và quan trọng hơn, nhiều anh chị thảo luận ở trên, sinh tin học (bioinformatics) là một ngành học khá hóc búa (nhưng thật sự hay đấy) vì nó kết hợp: sinh học, tin học, toán học (thống kê xác suất), hóa học... và chăm học nữa.


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
Hiển thị những bài viết cách đây:  Sắp xếp theo  
Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 20 bài viết ]  Chuyển đến trang Trang trước  1, 2

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Ai đang trực tuyến?

Đang xem chuyên mục này: Không có thành viên nào đang trực tuyến2 khách


Bạn không thể tạo chủ đề mới trong chuyên mục này.
Bạn không thể trả lời bài viết trong chuyên mục này.
Bạn không thể sửa những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể xoá những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể gửi tập tin đính kèm trong chuyên mục này.

Tìm kiếm với từ khoá:
Chuyển đến:  
cron
POWERED_BY
Vietnamese language pack for phpBB 3.0.x download and support.