Nhà Sinh Học Trẻ

Diễn Đàn của những Bạn Trẻ yêu thích Sinh Học
Hôm nay, Thứ bảy 15/08/20 2:22 am

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Nội quy chuyên mục


Không gởi bài xin tài liệu trong chuyên mục này (xem chuyên mục "Tài liệu theo yêu cầu")



Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 3 bài viết ] 
Người gửi Nội dung
 Tiêu đề bài viết: Gây đột biến ảo
Gửi bàiĐã gửi: Chủ nhật 03/08/08 2:04 pm 
Ngoại tuyến
chaos

Ngày tham gia: Chủ nhật 03/08/08 1:43 pm
Bài viết: 2
Đến từ: nơi nào đó
Em hiện là sinh viên và đang muốn nghiên cứu gây đột biến ảo. Giả sử có 1 đoạn Protein, và ta muốn gây đột biến để tăng tính ưa nước, nhưng hoạt tính vẫn được giữ nguyên hoặc giảm hoạt tính chỉ 1 ít, nhưng em ko biết nân bắt đầu từ đâu và dùng phần mềm gì? Rất mong được các anh chị và thầy cô chỉ bảo thêm :?:

_________________
Be yourself________________________________________________hieutthh______________


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Gây đột biến ảo
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 05/08/08 7:39 pm 
Ngoại tuyến
god - active member
god - active member
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ hai 21/02/05 12:20 am
Bài viết: 977
Đến từ: Uni. Stuttgart, Germany
hieutthh đã viết:
Em hiện là sinh viên và đang muốn nghiên cứu gây đột biến ảo. Giả sử có 1 đoạn Protein, và ta muốn gây đột biến để tăng tính ưa nước, nhưng hoạt tính vẫn được giữ nguyên hoặc giảm hoạt tính chỉ 1 ít, nhưng em ko biết nân bắt đầu từ đâu và dùng phần mềm gì? Rất mong được các anh chị và thầy cô chỉ bảo thêm :?:
Không có phần mềm nào có thể giúp bạn dự đoán được đặc tính protein sau khi tạo đột biến (điểm) trên cấu trúc phân tử protein. Phương pháp tạo đột biến ảo như bạn đề cập, "tưởng tượng thì dễ nhưng làm rất khó" vì protein là một đại phân tử có cấu trúc phức tạp và rất linh động (trong cấu trúc và chức năng), trong khi hiểu biết của con người về sự đáp ứng của protein trong trường hợp xảy ra các đột biến còn rất hạn chế.

Để làm được điều này phải có cấu trúc phân tử protein. Các bước tiến trình gồm: cấu trúc protein -> tạo đột biến -> thực hiện tính toán cấu hình mới của protein/độ phân cực/ điện tích... bằng các phần mềm và bằng mô phỏng động lực học phân tử -> so sánh với protein tự nhiên để kết luận xem protein có thể có tính chất mới và vẫn giữ nguyên hoạt tính hay không. Phương pháp này không phải lúc nào cũng thực hiện được hay thành công. Kết quả trong đa số trường hợp là 5 ăn 5 thua. Thời gian thực hiện nhiều khi kéo dài vài tháng đến vài năm, và có thể là một đề tài nghiên cứu cho hoc vị tiến sĩ. Ngoài yếu tố con người, những nghiên cứu kiểu này cũng cần nhiều thiết bị tính toán (máy tính) và phần mềm hỗ trợ.

Vì thế, trong nghiên cứu người ta thường chọn phương pháp thực nghiệm dựa trên mô hình "thử và sai". Thực hiện đột biến trên tất cả các vị trí rồi khảo sát hoạt tính, tìm xem đột biến ở vị trí nào thì thành công. Cách này trước đây thường được dùng để tạo một thư viện đột biến, nhưng rất mất thời gian. Ngày nay, với các máy robot tự động thao tác, thời gian thực hiện đã rút ngắn lại rất nhiều.

Một cách khác, đơn giản nhưng hiệu quả hơn là so sánh trình tự phân tử protein mình cần tạo đột biến với những protein có những tính chất tương tự đã biết. Từ đó rút ra nhận xét về các vị trí có khả năng thay đổi tính chất protein khi thực hiện đột biến. Tiếp theo thực hiện đột biến điểm định hướng để khảo sát. Xác suất thành công của phương pháp này cũng tùy thuộc vào mức độ hiểu biết của mình về protein mục tiêu.

Tóm lại, không có phần mềm nào có thể đơn giản trả lời cho câu hỏi của mình "tạo đột biến ở đâu thì có ý nghĩa?". Muốn tìm hiểu "đột biến ảo" như bạn nghĩ phải mất nhiều thời gian, tiền bạc và công sức để thực hiện. Nhiều khi xác suất thành công cũng không cao như mong muốn.

_________________
atuan


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Gây đột biến ảo
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 05/08/08 10:47 pm 
Ngoại tuyến
chaos

Ngày tham gia: Chủ nhật 03/08/08 1:43 pm
Bài viết: 2
Đến từ: nơi nào đó
Cám ơn anh atuan, qa những góp ý của anh em đã có thêm những định hướng ban đầu, vạn sự khởi đầu nan mà, chưa có thì sẽ tìm, mà fail thì ít ra cũng có được những kinh nghiệm nhất định :)

_________________
Be yourself________________________________________________hieutthh______________


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
Hiển thị những bài viết cách đây:  Sắp xếp theo  
Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 3 bài viết ] 

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Ai đang trực tuyến?

Đang xem chuyên mục này: Không có thành viên nào đang trực tuyến3 khách


Bạn không thể tạo chủ đề mới trong chuyên mục này.
Bạn không thể trả lời bài viết trong chuyên mục này.
Bạn không thể sửa những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể xoá những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể gửi tập tin đính kèm trong chuyên mục này.

Tìm kiếm với từ khoá:
Chuyển đến:  
cron
POWERED_BY
Vietnamese language pack for phpBB 3.0.x download and support.