Nhà Sinh Học Trẻ

Diễn Đàn của những Bạn Trẻ yêu thích Sinh Học
Hôm nay, Thứ năm 13/08/20 12:49 pm

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Nội quy chuyên mục


Không gởi bài xin tài liệu trong chuyên mục này (xem chuyên mục "Tài liệu theo yêu cầu")



Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 9 bài viết ] 
Người gửi Nội dung
 Tiêu đề bài viết: Phân biệt Null và Knockout mice
Gửi bàiĐã gửi: Thứ tư 04/10/06 10:16 am 
Ngoại tuyến
fungi
fungi
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ sáu 31/03/06 5:45 pm
Bài viết: 117
Đến từ: Sweet world
Mọi người có thể phân biệt dùm em hai thuật ngữ di truyền này không? Choco thấy cả hai đều gián đoạn gene mục tiêu và ứng dụng cho việc tìm hiểu function của gene mục tiêu này. Tuy nhiên tại sao dùng null và knockout?:
Và khi nào thì người ta thiết kế thí nghiệm null mice và khi nào thì thiết kế knockout mice? :roll:
Thank you for your time!


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ hai 09/10/06 11:10 pm 
Ngoại tuyến
fungi
fungi
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ ba 07/02/06 3:14 pm
Bài viết: 82
Đến từ: Coi hu vo...
Theo như IS biết thì null mice: natural còn knock out mice: artificial, còn cơ chế và ứng dụng của từng loại, hic, từ từ để IS đọc tiếp đã :D
Thật tình thì IS cũng quá "lơ tơ mơ" về cái dzụ này. Các bác giúp IS và chocolate với. Đa tạ các bác lắm lắm ;)


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Phân biệt Null và Knockout mice
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 10/10/06 4:45 am 
Ngoại tuyến
fungi
fungi

Ngày tham gia: Thứ sáu 15/04/05 5:48 am
Bài viết: 78
Đến từ: www.sinhhocvietnam.com
chocolate đã viết:
Mọi người có thể phân biệt dùm em hai thuật ngữ di truyền này không? Choco thấy cả hai đều gián đoạn gene mục tiêu và ứng dụng cho việc tìm hiểu function của gene mục tiêu này. Tuy nhiên tại sao dùng null và knockout?:
Và khi nào thì người ta thiết kế thí nghiệm null mice và khi nào thì thiết kế knockout mice? :roll:
Thank you for your time!


theo tôi hiểu thì nếu nói về approach thiết kế thí nghiệm thì nhiều lúc 2 thuật ngữ này dùng tương đương nhau. Tuy nhiên, nếu xét cẩn thận thì có thể thấy rằng knocknout = kỹ thuật/mục tiêu loss of function một gene/locus nhất định. Tuy nhiên, cái con chuột đã bị knockout này chưa chắc đã null về đặc tính (vì có thể tương tác gene/ gene đa locus .vv.). Như vậy null là nói đến 1 phenotype hoặc 1 enzyme /protein nhất định bị biến mất hoàn toàn mà để khẳng định đã tạo được null thì ngoài việc knockout hết các gene/allele trong họ thì phải characterize dòng chuột cẩn thận.

_________________
Hình ảnh
Thư viện Khoa học
Bản đồ Văn hóa


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 10/10/06 11:04 am 
Ngoại tuyến
fungi
fungi
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ sáu 31/03/06 5:45 pm
Bài viết: 117
Đến từ: Sweet world
cám ơn anh vietbio va IS! Vậy knockout chỉ kỹ thuật, còn null chỉ tính chất của loss function protein. Do đó người ta thường chỉ nói knockout 1 gene chứ không nói allele, chỉ dùng null allele thôi, phải khong anh?
Vậy cho em hỏi thêm là cách thức để characterize kỹ để xác định null có phải dùng southern hoặc western blot hay còn thêm cách nào nữa?
Một câu hỏi khác liên quan đến việc tạo recombinant để loại bỏ đoạn gene mục tiêu bằng sử dụng Cre.
Theo em biết thì đây là cách để người ta hạn chế việc chết sớm của chuột trong giai đoạn bào thai vì liên quan đến function của target knockout gene. Nói cách khác nếu gene này bị mất thì ảnh hưởng chết sớm ở giai đoạn bào thai, mà mục tiêu nghiên cứu gene này là giai đoạn thành thục. Do đó người ta sẽ cho gene này hoạt động bình thường ở giai đoạn mang thai, đến lúc chuột sinh trưởng sẽ tác động đến biểu hiện gene Cre và lúc này sẽ knockout đoạn gene function.
Tuy nhiên đây chỉ là cách em tưởng tượng ra từ lý thuyết thôi, chứ không biết thực hư thế nào? Em muốn confirm lại! Nếu đúng vậy, thì làm thế nào để tác động cho Cre biểu hiện?


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 10/10/06 1:35 pm 
Ngoại tuyến
Chuyên gia
Chuyên gia

Ngày tham gia: Thứ năm 19/01/06 3:43 pm
Bài viết: 84
chocolate đã viết:
cám ơn anh vietbio va IS! Vậy knockout chỉ kỹ thuật, còn null chỉ tính chất của loss function protein. Do đó người ta thường chỉ nói knockout 1 gene chứ không nói allele, chỉ dùng null allele thôi, phải khong anh?
Vậy cho em hỏi thêm là cách thức để characterize kỹ để xác định null có phải dùng southern hoặc western blot hay còn thêm cách nào nữa?
Một câu hỏi khác liên quan đến việc tạo recombinant để loại bỏ đoạn gene mục tiêu bằng sử dụng Cre.
Theo em biết thì đây là cách để người ta hạn chế việc chết sớm của chuột trong giai đoạn bào thai vì liên quan đến function của target knockout gene. Nói cách khác nếu gene này bị mất thì ảnh hưởng chết sớm ở giai đoạn bào thai, mà mục tiêu nghiên cứu gene này là giai đoạn thành thục. Do đó người ta sẽ cho gene này hoạt động bình thường ở giai đoạn mang thai, đến lúc chuột sinh trưởng sẽ tác động đến biểu hiện gene Cre và lúc này sẽ knockout đoạn gene function.
Tuy nhiên đây chỉ là cách em tưởng tượng ra từ lý thuyết thôi, chứ không biết thực hư thế nào? Em muốn confirm lại! Nếu đúng vậy, thì làm thế nào để tác động cho Cre biểu hiện?


Lv xin phép được bổ sung thêm:
Knockout: thường dùng "knock out a gene's expression" but does not knock out expression completely.
A knock down technique: Usually associated with a technique used to knock out a gene's expression but does not knock out expression completely. RNAi is sometimes considered a knock down technique

Null: thường dùng "null mutant" hay "null mutation" = any mutation that leads to a complete los of function of the sequence in which it occurs

Liên quan đến Cre
Choco suy luận gần đúng rồi. Lv xin bổ sung chút chút. Trong kỹ thuật tạo recombinant sử dụng Cre, người ta có thể chủ động điều khiển thời điểm xảy ra recombination thông qua các promoter hoạt động có điều kiện (vd. shock nhiệt...). như sau: Target gene được đặt giữa Cre recombinase target site. Recombination chỉ xảy ra khi có mặt Cre recombinase. Cre recombinase được tổng hợp dưới sự điều khiển của một trong các loại promoter hoạt động có điều kiện (thường dùng là hs, nhạy cảm nhiệt độ). Do vậy, có thể chủ động điều khiển recombination tùy theo thời điểm mong muốn.

_________________
Living things share common genes


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ tư 11/10/06 1:22 pm 
Ngoại tuyến
fungi
fungi
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ sáu 31/03/06 5:45 pm
Bài viết: 117
Đến từ: Sweet world
Thank anh/chị living nhiều! :D


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 31/10/06 6:32 pm 
Ngoại tuyến
coaserva
coaserva

Ngày tham gia: Thứ năm 23/02/06 10:27 am
Bài viết: 9
Em đang có một thắc mắc nhưng chẳng biết post vào đâu, vả lại cũng nói về transgenic animal nên em post vào đây luôn.
Nghe các anh chị bàn về knock-out mice và null mice vậy thì knock-in mice có giống như thế không? và làm thế nào để tạo được knock-in mice. Cám ơn các anh chị [Idon'-know]

_________________
Nơi ấy là chân trời...


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ bảy 04/11/06 7:27 pm 
Ngoại tuyến
fungi
fungi
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ sáu 31/03/06 5:45 pm
Bài viết: 117
Đến từ: Sweet world
Rainbow đã viết:
Em đang có một thắc mắc nhưng chẳng biết post vào đâu, vả lại cũng nói về transgenic animal nên em post vào đây luôn.
Nghe các anh chị bàn về knock-out mice và null mice vậy thì knock-in mice có giống như thế không? và làm thế nào để tạo được knock-in mice. Cám ơn các anh chị [Idon'-know]

Tương tự như knock-out thôi... :)
Bước 1: Tạo vector chứa gene mục tiêu X (gene mục tiêu thường là cDNA)
Bước 2: Homologous recombination (LoxP and Cre)
Gene cần knock-in: _____>=====<____
Vector chứa gene X cần chuyển vào: ____>xxxx<______
Recombinant thành công: ____>xxxx<_____
Bước 3: Screening bằng PCR hay Southern blot
Bước 4: Injection vào blastocyst của chuột
Bước 5: Chọn dòng chimera


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re:
Gửi bàiĐã gửi: Thứ ba 13/05/08 4:02 pm 
Ngoại tuyến
chaos

Ngày tham gia: Thứ ba 13/05/08 3:31 pm
Bài viết: 2
chocolate đã viết:
Rainbow đã viết:
Em đang có một thắc mắc nhưng chẳng biết post vào đâu, vả lại cũng nói về transgenic animal nên em post vào đây luôn.
Nghe các anh chị bàn về knock-out mice và null mice vậy thì knock-in mice có giống như thế không? và làm thế nào để tạo được knock-in mice. Cám ơn các anh chị [Idon'-know]

Tương tự như knock-out thôi... :)
Bước 1: Tạo vector chứa gene mục tiêu X (gene mục tiêu thường là cDNA)
Bước 2: Homologous recombination (LoxP and Cre)
Gene cần knock-in: _____>=====<____
Vector chứa gene X cần chuyển vào: ____>xxxx<______
Recombinant thành công: ____>xxxx<_____
Bước 3: Screening bằng PCR hay Southern blot
Bước 4: Injection vào blastocyst của chuột
Bước 5: Chọn dòng chimera

-----------------------------------------------------------------------------------------
Ở Việt Nam có nơi nào đã dùng kỹ thuật này chưa? Cảm ơn!


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
Hiển thị những bài viết cách đây:  Sắp xếp theo  
Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 9 bài viết ] 

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Ai đang trực tuyến?

Đang xem chuyên mục này: Không có thành viên nào đang trực tuyến2 khách


Bạn không thể tạo chủ đề mới trong chuyên mục này.
Bạn không thể trả lời bài viết trong chuyên mục này.
Bạn không thể sửa những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể xoá những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể gửi tập tin đính kèm trong chuyên mục này.

Tìm kiếm với từ khoá:
Chuyển đến:  
POWERED_BY
Vietnamese language pack for phpBB 3.0.x download and support.